| 秋原タウン |
| メイルの家の裏にある木にプラグインする |
| じゅもくの電脳にあるミニサーバーを調べるとサーチマンＶ２と対決 |
| ヒグレヤ |
| ひみつきちにいる炎山に話しかける |
| 科学省 |
| ロビーの入り口付近にあるたんまつにプラグインしてミニサーバーに近づくとマグネットマンＶ２と対決 |
| ごうかきゃくせんのかんぱんのネットバトルマシンに近づく |
| エンドシティ |
| シャチホコの電脳４の奥に行くとジャイロマンＶ２と対決 |
| 電脳世界 |
| ウラインターネット４の奥に行く |
| 秋原タウン |
| 熱斗のリビングに行く |
| 電脳世界 |
| 科学省エリア３の右上の広場の左から３番目を調べる |
| パストビジョン（昔の科学省）に行く |
| 熱斗のへや |
| ベッドを調べて寝る |
| 熱斗のリビング |
| ママに話しかける |
| 秋原タウン |
| ヒグレヤ前にいる炎山に話しかける |
| ネビュラ本拠地 |
| ファクトリーろうかに入る |
| トビラの前まで行く |
| ダークチップファクトリーを少し進む |
| ファクトリーの電脳１ |
| 奥まで進むとブリザードマンＶ２と対決 |
| 赤のボタンはマグネットマン青のボタンはロックマンが押す |
| 順番は赤→青→赤→青→赤 |
| ネビュラ本拠地 |
| テスラに話しかける |
| ダークチップファクトリーの先に進む |
| ファクトリーの電脳２ |
| 奥に進むとシェードマンＶ２と対決 |
| ボタンを踏む順番は黄色→青→黄色→青→黄色 |
| ネビュラ本拠地 |
| ダークチップファクトリーの先に進み電磁バリアを調べる |
| ファクトリーの電脳３ |
| 奥まで行くとクラウドマンＶ２と対決 |
| ネビュラ本拠地 |
| ダークチップファクトリーの先まで進む |
| ファクトリーの電脳４ |
| 奥に進むとコスモマンＶ２と対決 |
| ボタンを踏む順番は赤→ピンク→赤→ピンク→赤とピンクの壁のところまで進む→赤→ピンク→青→赤→ピンク |
| ネビュラ本拠地 |
| ネビュラしれい室に入って奥まで行く |
| じっけんサーバーの電脳で倒れているナビに話しかける |
| 一番手前のチップケースを調べる |
| 中央のチップケースを調べる |
| 奥に進む |
| ココロサーバーの電脳の奥に行くとネビュラグレイと対決（セーブ不可） |
| エンディング |